1. Direktur Eksekutif
    1. Deputi Direktur Bidang Administrasi dan Keuangan
      1. Keuangan
      2. Administrasi
      3. Pendukung
    2. Deputi Direktur Bidang Pengembangan Program
      1. Divisi Kehutanan dan Lahan
      2. Divisi Pengendalian Pencemaran Lingkungan Hidup
      3. Divisi Pesisir dan Maritim
    3. Deputi Direktur Bidang Monitoring, Evaluasi dan Manajemen
      Pengetahuan
      1. Monitoring dan Evaluasi
      2. Manajemen Pengetahuan